直面真菌感染诊断差距

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近年来,真菌感染的增加让专家们感到困扰。 COVID-19大流行过后,耳念珠菌(Candida auris)的定植和感染有所增加。根据美国疾病控制与预防中心(CDC)的数据,这种趋势在广泛的范围内上升。CDC报告称,2020年美国有757例C. auris的临床病例和1310例筛查病例。到2022年临床病例增加到2377例,筛查病例增加到5754例。耳念珠菌在医院环境中引起了爆发,并且对多种药物具有耐药性。

同样令人担忧的是最近有关印度毛癣菌(Trichophyton indotineae)耐药的报道。虽然最初在印度报道,但这种新型皮肤真菌现在也在美国和中国报告,2021年至2023年间在纽约市首次出现病例。根据印度的数据,印度毛癣菌对特比萘芬的耐药几乎达到了70%。最新的报道显示,一种耐唑类药物的近平滑念珠菌(Candida parapsilosis)也出现了。

这些感染对免疫功能低下的患者以及患有各种疾病的非免疫功能低下的患者构成威胁,其中移植和血液肿瘤患者的风险尤其高。但情况并不总是那么明确——有时感染背后隐藏着一种不太常见的真菌生物。这可能具有挑战性,必须根据具体情况进行处理。 不能只依赖一种检测,必须审视整体情况和其他实验室检测项目。

为了了解实验室界应对日益增长的威胁的能力,真菌诊断实验室联盟(https://labs.pathology.jhu.edu/fdlc/)对其成员做了调查,并指出了真菌诊断在特定疾病以及方法和途径方面的一些差距(Zhang SX等,J Clin Microbiol. 2021;59[7]:e0178420)。

这是一份发人深省的清单:

  • 缺乏毛霉菌病的分子检测。

  • 缺乏使用真菌生物标志物和分子工具来早期准确诊断肺孢子菌肺炎、曲霉病、念珠菌血症和地方性真菌病的最佳诊断算法。

  • 缺乏标准化的分子方法来直接识别福尔马林固定、石蜡包埋的组织中的真菌病原体。

  • 缺乏强大的数据库以增强使用基质辅助激光解吸/飞行时间质谱法进行的霉菌识别。

  • 针对新的、正在出现的或未被充分认识的、罕见或不常见的真菌病原体进行即时检测的能力不足。

  • 抗真菌药敏试验的性能。

该联盟在《临床微生物学杂志》评论中进一步优先考虑了其发现,包括讨论如何弥补六种特定疾病的差距。

肺孢子菌肺炎是由酵母样真菌耶氏肺孢子菌引起的。作者指出,近年来,实验室已经能够使用呼吸道样本的核酸扩增测试来直接检测耶氏疟原虫 DNA,这种方法比作为金标准的直接显微方法具有更高的灵敏度。然而,该方法缺乏核酸扩增测试和定量 NAAT 的标准化。 β-d-葡聚糖用作肺孢子虫肺炎的诊断辅助剂,但有其自身的局限性,包括缺乏特异性以及对其最佳临界值和阴性预测值的疑问。

联盟成员呼吁重新评估分离毛霉菌的最佳组织处理方法。尽管在接种到培养皿上之前通过切碎而不是均质来处理组织样本一直是标准做法,但没有研究支持这种做法。 开发毛霉菌NAAT来早期诊断毛霉菌病,提高患者生存率也是有用的。

NAAT与半乳甘露聚糖抗原检测联合使用,也可能对诊断侵袭性曲霉病有用。曲霉NAAT的潜在优势可能包括周转时间短、与单独使用半乳甘露聚糖相比具有更高的临床特异性、区分曲霉菌属的能力以及检测抗真菌耐药性标志物。

联盟成员希望看到一种针对念珠菌血症的快速检测算法。念珠菌血症是医疗机构中最常见的血流感染之一,也是危重ICU患者中主要的严重真菌感染。其他高危人群包括恶性肿瘤、移植、免疫抑制、腹部手术、长期广泛使用抗菌药物和注射吸毒者。更快地检测和鉴定念珠菌属可以降低死亡率。

地方性真菌病(组织胞浆菌病、芽生菌病和球孢子菌病)的诊断需要表现得更好,并得到更广泛的应用。培养、组织学/细胞学研究、抗原检测、血清学和分子诊断都可能是检测和鉴定这些真菌病原体的改进方法的一部分。

最棘手的差距之一是解决新出现的和未被充分认识的真菌病原体,例如现在熟悉的耳念珠菌。引起血流感染的其他罕见或不常见的酵母包括不常见的念珠菌属、隐球菌属(新形隐球菌和加特隐球菌除外)、毛孢子菌、红酵母、马拉色菌、地霉和土毛菌。大多数感染与导管相关或由于抗真菌治疗的突破。

过去,制造商对开发真菌诊断市场的检测不够投入,部分原因是因为认为投资回报率低,因为真菌感染的数量和患病率都很低。但这最近已经改变了,越来越多的公司对将试剂盒投放市场以提高真菌诊断的准确性和速度感兴趣。

直面真菌感染诊断差距-第1张图片-爱来健康

世界卫生组织2022年将 19 种真菌病原体(见上面的列表)列为对公众健康威胁最大的病原体,并指出新的群体在侵袭性真菌病的风险不断被识别(世卫组织真菌优先病原体清单,指导研究、开发和公共卫生行动.pdf (访问密码: 1454))。这是一份非常重要的文件,它引起人们对真菌感染的强烈关注。


标签: 真菌感染 诊断

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